Etude de la diversité génétique de quelques variétés locales de figuier (Ficus carica L) en Algérie. Doctorat thesis, (2019) Université de Batna 2.
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Date
2019-09-26
Authors
BOUDCHICHA RIMA HIND
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Abstract
La connaissance et caractérisation des ressources phyto génétiques sont des enjeux majeurs pour le pays afin de protéger et de valoriser notre patrimoine génétique. Une bonne conservation et gestion des ressources génétiques locales nécessite au préalable une évaluation et une identification de la variabilité présente dans les collections in situ et ex situ. Le figuier (Ficus carica L.) est un arbre emblématique du bassin méditerranéen possédant une identification complexe. Notre étude caractérise pour la première fois 8 cultivars de figuier moyennant les descripteurs morphologiques de l’PGRI, et 34 cultivars de figuier locaux en utilisant 24 marqueurs microsatellites. A partir des 59 variables phénotypiques dont 18 sont quantitatives et 41 qualitatives, initialement choisies, 32 variables ont été sélectionnées dont 10 sont quantitatives et 22 qualitatives. Ses dernières sont subdivisées en 65 caractères qui ont été groupés par l’analyse de composante principale en 7 composantes principales expliquant 100% de la variabilité. La classification hiérarchique dérivée à partir d’une matrice de similarité des quatre premières composantes, qui expliquent au moins 70 % de la variabilité, a permis de séparer les 8 cultivars en 5 groupes distincts. Les caractères quantitatifs sélectionnés ont permis de distinguer les cultivars selon leurs types de production (bifère ou unifère). Tandis que les variables qualitatives sélectionnées ont permis de classer les cultivars suivant leurs traits pomologiques, en premier lieu (forme du fruit, couleur de la peau et de la pulpe, forme de l’apex), puis par quelques caractères de la feuille (nombre de lobe, forme du lobe centrale et forme de la base de la feuille). Ces résultats ont montré l’efficacité des marqueurs morphologiques dans l’identification des cultivars de figuier et a permis de sélectionner les caractères phénotypiques les plus discriminants. Cette caractérisation a été appuyée par une identification moléculaire de 34 cultivars de figuier en utilisant 24 marqueurs microsatellites dont deux ont été écartés de l’étude à cause de leur monomorphisme. Les 22 SSRs restants ont montré une diversité génétique modérée avec une structuration faible et similaire à celles rapportées par d’autres études réalisées sur des collections de figuier provenant de différents pays. L’analyse UPGMA a classé les 77 accessions représentant les 34 cultivars en 35 groupes révélant des cas d’homonymies et de synonymies dans la collection étudiée. Les cultivars provenant des collections de notre pays ont montré une faible diversité génétique en comparaison avec une collection espagnole, d’où l’importance d’élargir les collections présentes avec l’introduction de nouveau cultivars locaux. Ces résultats démontrent l’importance de la caractérisation phénotypique et moléculaire dans la gestion de la variabilité et la différentiation entre les cultivars maintenus dans des collections ce qui permettra un gain d’efforts et de temps considérables